ຊຸດ Mouse Genotyping
ໝາຍເລກແມວ: HCR2021A
ຜະລິດຕະພັນນີ້ແມ່ນຊຸດທີ່ຖືກອອກແບບມາສໍາລັບການກໍານົດຢ່າງໄວວາຂອງ genotypes ຂອງຫນູ, ລວມທັງການສະກັດເອົານ້ໍາມັນດິບ DNA ແລະລະບົບການຂະຫຍາຍ PCR.ຜະລິດຕະພັນສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ສໍາລັບການຂະຫຍາຍ PCR ໂດຍກົງຈາກຫາງຫນູ, ຫູ, toe ແລະແພຈຸລັງອື່ນໆຫຼັງຈາກ cleavage ງ່າຍດາຍໂດຍ Lysis Buffer ແລະ Proteinase k.ບໍ່ມີການຍ່ອຍອາຫານຂ້າມຄືນ, ການສະກັດເອົາ phenol-chloroform ຫຼືການຊໍາລະລ້າງຖັນ, ເຊິ່ງງ່າຍດາຍແລະຫຼຸດຜ່ອນເວລາຂອງການທົດລອງ.ຜະລິດຕະພັນແມ່ນເຫມາະສົມສໍາລັບການຂະຫຍາຍຊິ້ນສ່ວນເປົ້າຫມາຍເຖິງ 2kb ແລະຕິກິຣິຍາ PCR multiplex ທີ່ມີເຖິງ 3 ຄູ່ primers.ການປະສົມ 2 × Mouse Tissue Direct PCR ປະກອບດ້ວຍ DNA polymerase ທີ່ຖືກວິສະວະກໍາພັນທຸກໍາ, Mg2+, dNTPs ແລະລະບົບ buffer ທີ່ດີທີ່ສຸດເພື່ອໃຫ້ປະສິດທິພາບການຂະຫຍາຍສູງແລະຄວາມທົນທານຂອງ inhibitor, ດັ່ງນັ້ນປະຕິກິລິຍາ PCR ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໂດຍການເພີ່ມແມ່ແບບແລະ primers ແລະ rehydrating ຜະລິດຕະພັນ 1 ×.ຜະລິດຕະພັນ PCR ຂະຫຍາຍດ້ວຍຜະລິດຕະພັນນີ້ມີພື້ນຖານ "A" ທີ່ໂດດເດັ່ນຢູ່ປາຍ 3′ ແລະສາມາດນໍາໃຊ້ໄດ້ໂດຍກົງສໍາລັບການໂຄນ TA ຫຼັງຈາກການຊໍາລະລ້າງ.
ອົງປະກອບ
ອົງປະກອບ | ຂະໜາດ |
2× Mouse Tissue Direct PCR Mix | 5×1.0ml |
Lysis Buffer | 2×20ml |
ໂປຣຕີນ K | 800μL |
ເງື່ອນໄຂການເກັບຮັກສາ
ຜະລິດຕະພັນຄວນເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ -25 ~ -15 ℃ 2 ປີ.ຫຼັງຈາກ thawing, Lysis Buffer ສາມາດເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ 2 ~ 8 ℃ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຫຼາຍໃນໄລຍະສັ້ນ, ແລະປະສົມໃຫ້ດີໃນເວລານໍາໃຊ້.
ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ
ຜະລິດຕະພັນນີ້ແມ່ນເຫມາະສົມສໍາລັບການວິເຄາະ knockout ຫນູ, ການກວດຫາ transgenic, genotyping ແລະອື່ນໆ.
ຄຸນລັກສະນະ
1.ການດໍາເນີນງານງ່າຍດາຍ: ບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງສະກັດ DNA genomic;
2.ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກກ້ວາງ: ເຫມາະສົມສໍາລັບການຂະຫຍາຍໂດຍກົງຂອງເນື້ອເຍື່ອຫນູຕ່າງໆ.
ຄໍາແນະນໍາ
1.ການປ່ອຍຕົວຂອງ DNA ພັນທຸ ກຳ
1) ການກະກຽມຂອງ lysate
Tissue lysate ໄດ້ຖືກກະກຽມຕາມຈໍານວນຂອງຕົວຢ່າງຫນູທີ່ຈະ lysed (ເນື້ອເຍື່ອ lysate ຄວນຖືກກະກຽມຢູ່ໃນບ່ອນຕາມປະລິມານແລະປະສົມຢ່າງລະອຽດສໍາລັບການນໍາໃຊ້), ແລະອັດຕາສ່ວນຂອງ reagents ທີ່ຕ້ອງການສໍາລັບຕົວຢ່າງດຽວແມ່ນດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້:
ອົງປະກອບ | ປະລິມານ (μL) |
ໂປຣຕີນ K | 4 |
Lysis Buffer | 200 |
2) ການກະກຽມຕົວຢ່າງແລະ Lysis
ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ Tissue
ປະເພດເນື້ອເຍື່ອ | ປະລິມານທີ່ແນະນໍາ |
ຫາງຫນູ | 1-3 ມມ |
ຫູຫນູ | 2-5 ມມ |
ຕີນຫນູ | 1-2 ຕ່ອນ |
ເອົາຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອຫນູໃນປະລິມານທີ່ເຫມາະສົມໃນທໍ່ centrifuge ທີ່ສະອາດ, ເພີ່ມ 200μL ຂອງເນື້ອເຍື່ອສົດ lysate ໃສ່ແຕ່ລະທໍ່ centrifuge, vortex ແລະສັ່ນ, ຫຼັງຈາກນັ້ນ incubate ທີ່ 55 ℃ສໍາລັບ 30 ນາທີ, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນໃຫ້ຄວາມຮ້ອນຢູ່ທີ່ 98 ℃ສໍາລັບ 3 ນາທີ.
3) Centrifugation
ສັ່ນ lysate ໄດ້ດີແລະ centrifuge ທີ່ 12,000 rpm ສໍາລັບ 5 ນາທີ.supernatant ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເປັນແມ່ແບບສໍາລັບການຂະຫຍາຍ PCR.ຖ້າແມ່ແບບຕ້ອງການສໍາລັບການເກັບຮັກສາ, ໂອນ supernatant ໄປໃສ່ທໍ່ centrifuge ອື່ນທີ່ເປັນຫມັນແລະເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ -20 ℃ເປັນເວລາ 2 ອາທິດ.
2.ການຂະຫຍາຍ PCR
ເອົາ 2 × Mouse Tissue Direct PCR Mix ຈາກ -20 ℃ ແລະ thaw ເທິງກ້ອນ, ປະສົມກັບ upside ລົງແລະກະກຽມລະບົບປະຕິກິລິຍາ PCR ຕາມຕາຕະລາງຕໍ່ໄປນີ້ (ດໍາເນີນການເທິງກ້ອນ):
ອົງປະກອບ | 25μLລະບົບ | 50μLລະບົບ | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນສຸດທ້າຍ |
2× Mouse Tissue Direct PCR Mix | 12.5μL | 25μL | 1× |
primer 1 (10μM) | 1.0μL | 2.0μL | 0.4 ມມ |
Primer 2 (10μM) | 1.0μL | 2.0μL | 0.4 ມມ |
ຜະລິດຕະພັນ Cleavagea | ຕາມຄວາມຕ້ອງການ | ຕາມຄວາມຕ້ອງການ |
|
ddH2O | ສູງເຖິງ 25μL | ເຖິງ 50μL |
|
ຫມາຍເຫດ:
a) ປະລິມານທີ່ເພີ່ມບໍ່ຄວນເກີນ 1/10 ຂອງລະບົບ, ແລະຖ້າເພີ່ມຫຼາຍເກີນໄປ, PCR amplification ອາດຈະຖືກຍັບຍັ້ງ.
ເງື່ອນໄຂ PCR ທີ່ແນະນໍາ
ຂັ້ນຕອນຮອບວຽນ | ອຸນຫະພູມ. | ເວລາ | ຮອບວຽນ |
ການສະແດງອອກເບື້ອງຕົ້ນ | 94℃ | 5 ນາທີ | 1 |
ລັກສະນະ | 94℃ | 30 ວິ | 35-40 |
ການຫົດຕົວa | Tm+3~5℃ | 30 ວິ | |
ສ່ວນຂະຫຍາຍ | 72 ℃ | 30 ວິ/ກິບ | |
ສ່ວນຂະຫຍາຍສຸດທ້າຍ | 72 ℃ | 5 ນາທີ | 1 |
- | 4 ℃ | ຖື | - |
ຫມາຍເຫດ:
a) ອຸນຫະພູມ Annealing: ໂດຍອ້າງອີງໃສ່ຄ່າ Tm ຂອງ primer, ແນະນໍາໃຫ້ຕັ້ງອຸນຫະພູມ annealing ກັບຄ່າ Tm ນ້ອຍກວ່າ primer +3 ~ 5 ℃.
ບັນຫາທົ່ວໄປແລະວິທີແກ້ໄຂ
1.ບໍ່ມີແຖບເປົ້າໝາຍ
1) ຜະລິດຕະພັນ lysis ຫຼາຍເກີນໄປ.ເລືອກຈໍານວນທີ່ເຫມາະສົມທີ່ສຸດຂອງແມ່ແບບ, ປົກກະຕິແລ້ວບໍ່ເກີນ 1/10 ຂອງລະບົບ;
2) ຂະຫນາດຕົວຢ່າງຂະຫນາດໃຫຍ່ເກີນໄປ.ເຈືອຈາງ lysate 10 ເທື່ອແລະຫຼັງຈາກນັ້ນຂະຫຍາຍ, ຫຼືຫຼຸດລົງຂະຫນາດຕົວຢ່າງແລະ re-lysis;
3) ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອບໍ່ສົດ.ມັນແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອສົດ;
4) ຄຸນນະພາບ primer ບໍ່ດີ.ໃຊ້ DNA genomic ສໍາລັບການຂະຫຍາຍເພື່ອກວດສອບຄຸນນະພາບ primer ແລະເພີ່ມປະສິດທິພາບການອອກແບບ primer.
2.ການຂະຫຍາຍທີ່ບໍ່ສະເພາະ
1) ອຸນຫະພູມ annealing ຕ່ໍາເກີນໄປແລະຈໍານວນວົງຈອນແມ່ນສູງເກີນໄປ.ເພີ່ມອຸນຫະພູມ annealing ແລະຫຼຸດຜ່ອນຈໍານວນຂອງຮອບວຽນ;
2) ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງແມ່ແບບສູງເກີນໄປ.ຫຼຸດຜ່ອນປະລິມານຂອງແມ່ແບບຫຼືເຈືອຈາງແມ່ແບບ 10 ເທື່ອຫຼັງຈາກການຂະຫຍາຍ;
3) ຄວາມສະເພາະຂອງ primer ບໍ່ດີ.ເພີ່ມປະສິດທິພາບການອອກແບບ primer.
ບັນທຶກ
1.ເພື່ອຫຼີກເວັ້ນການປົນເປື້ອນລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ, ເຄື່ອງມືການເກັບຕົວຢ່າງຫຼາຍຄວນຖືກກະກຽມ, ແລະຫນ້າດິນຂອງເຄື່ອງມືສາມາດເຮັດຄວາມສະອາດດ້ວຍການແກ້ໄຂ sodium hypochlorite 2% ຫຼືເຄື່ອງເຮັດຄວາມສະອາດອາຊິດນິວເຄຼຍຫຼັງຈາກການເກັບຕົວຢ່າງແຕ່ລະຄັ້ງຖ້າຕ້ອງການໃຊ້ຊ້ໍາຊ້ອນ.
2.ມັນແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ແພຈຸລັງຫນູສົດ, ແລະປະລິມານຕົວຢ່າງບໍ່ຄວນໃຫຍ່ເກີນໄປເພື່ອຫຼີກເວັ້ນການສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ຜົນໄດ້ຮັບການຂະຫຍາຍ.
3.Lysis Buffer ຄວນຫຼີກລ້ຽງການແຊ່ແຂງເລື້ອຍໆ, ແລະສາມາດເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ 2 ~ 8 ℃ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຫຼາຍໃນໄລຍະສັ້ນ.ຖ້າເກັບຮັກສາໄວ້ໃນອຸນຫະພູມຕ່ໍາ, ຝົນອາດຈະເກີດຂຶ້ນ, ແລະຕ້ອງໄດ້ຮັບການລະລາຍຢ່າງເຕັມສ່ວນກ່ອນທີ່ຈະນໍາໃຊ້.
4.PCR Mix ຄວນຫຼີກລ້ຽງການແຊ່ແຂງເລື້ອຍໆ, ແລະສາມາດເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ 4 ℃ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຊ້ໍາອີກໃນໄລຍະສັ້ນ.
5.ຜະລິດຕະພັນນີ້ແມ່ນສໍາລັບການຄົ້ນຄວ້າທົດລອງວິທະຍາສາດເທົ່ານັ້ນແລະບໍ່ຄວນໃຊ້ໃນການວິນິດໄສຫຼືການປິ່ນປົວທາງດ້ານຄລີນິກ.